Мультизональні системи дають можливість гнучко побудувати системи кондиціонування цілої будівлі за рахунок наявності можливості об’єднати управління і контроль декількох систем. Управління системою може бути здійснено як індивідуально (управління окремим внутрішнім блоком), так і централізовано (до 400 блоків у групі систем). Дані функції виконує «інтелектуальна» програма на базі персонального комп’ютера, яка працює в середовищі Windows, вона вибирає найбільш оптимальний спосіб виконання заданих установок, одночасно стежить за станом системи, веде журнал помилок і здійснює діагностику несправностей. Також система управління може інтегруватися в систему управління будівлею (підключатися до охоронної сигналізації, підключатися до протипожежної системі, управляти енергозбереженням), наприклад з інерфейса BMS або LonWorks.
